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Les habitats continentaux et marins, naturels ou semi-naturels, sont sous pression par l’artificialisation et la fragmentation des territoires, l’évolution des modèles agricoles, l’industrialisation ou les nombreuses activités maritimes.
La simplification des paysages agricoles, les atteintes aux zones humides, aux milieux aquatiques et aux habitats marins, la poursuite de la régression des milieux bocagers et prairiaux, constituent ainsi des sujets de préoccupation forts pour la conservation des espèces.